微信小程序是否只適合低頻應用？顧名思義，低頻應用就是大多數用戶平時不使用的應用，比如金融、醫療、公共服務等，這些應用是用戶訪問頻率較低的應用。相比之下，購物、美食、旅游、酒店等應用是用戶頻繁訪問的應用，被稱為高頻應用。有人認為微信小程序只適合低頻應用。他們認為小程序無法達到應用的使用效果和體驗，難以替代高頻應用。不過，張小龍在設計微信小程序時，定位為全媒體應用生態，并沒有區分應用的高頻和低頻。將來所有應用程序都將添加到小程序中。
微信小程序是應用商店小程序。很多用戶認為，它們與他們過去使用的360手機助手、百度手機助手、華為應用市場等應用管理軟件非常相似。事實上，小程序和應用商店的功能類似，但又不一樣。
（1）小程序中的所有應用都相當于微信小程序的子應用。通過微信小程序，用戶可以輕松打開230萬個應用，應用商店中的應用相互獨立。
（2）微信小程序作為應用管理平臺，只承擔搜索和刪除功能。用戶可以通過掃描二維碼、分享好友、搜索附近小程序、長按小程序選擇刪除功能等方式查找應用。此外，小程序在大部分應用商店中不涉及分類、列表、手機體檢、手機瘦身、推薦、垃圾清理等功能。小程序團隊希望給用戶最純粹的用戶體驗。
早在2017年，張小龍就表示他們不會做小程序的商店，也不會像外界猜測的那樣做App分發。小程序團隊從一開始就認為小程序不應該有中心入口，應該去中心化，所以他們不能對小程序進行分類、排名和推薦。
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