真正的搜索引擎指的是由蜘蛛程序沿著鏈接爬行和抓取網上的大量頁面，存進數據庫，經過預處理，用戶在搜索框輸入關鍵詞后，搜索引擎排序程序從數據庫中挑選出符合搜索關鍵詞要求的頁面，蜘蛛的爬行、頁面的收錄及排序都是自動處理。
網站目錄則是一套人工編輯的分類目錄，由編輯人員人工創建多個層次的外類，站長可以在不同分類里提交網站，目錄編輯在后臺審核所提交的網站，將網站放置于相應的分類頁面，有的時候編輯也主動收錄網站。典型的網站目錄包括雅虎目錄、開放目錄、好123等。
目錄并不是本書中所討論的SEO所關注的真正的搜索引擎，雖然網站目錄也常有個搜索框，但目錄的數據來源是人工編輯得到的。
搜索引擎和目錄兩者各有優劣
搜索引擎收錄的頁面數遠遠高于目錄能收錄的頁面數.但搜索引擎收錄的頁面質量參差不齊，對網站內容和關鍵詞提取的準確性通常也沒有目錄高。
限于人力，目錄能收錄的通常只是網站首頁，而且規模十分有限，不過收錄的網站通常質量比較高，像雅虎、開放目錄、好 123 這些大型目錄，收錄標準非常高。目錄收錄網站時存儲的頁面標題、說明文字都是人工編輯的，比較準確。
搜索引擎數據更新快，而 錄中收錄的很多網站內容十分陳舊，甚至網站叮能已經不再存在了。
雅虎目錄、搜狐目錄等曾經是用戶在網上尋找信息的主流方式，給用戶的感覺與真正的搜索引擎也相差不多，這也就是目錄有時候被誤稱為“搜索引擎的一種 ”的原因，但隨著 Google 等真正意義上的搜索引擎發展起來，目錄的使用迅速減少，現在已經很少有人使用網站目錄尋找信息了。現在的網站目錄對 北京SEO 優化的最大意義是建設外部鏈接，像雅虎開放目錄、好 123 等都有很高的權重，可以給被收錄的網站帶來一個高質量的外部鏈接 。
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